1. 研究目的与意义
癌症是世界上主要的死亡原因之一,它已经成为威胁全球公共健康的主要问题。根据最新统计,2020年年新增癌症病例约1930万例,癌症死亡近1000万例[1]。近年来,癌症的治疗方法和技术有了明显的进步。然而,完全揭示肿瘤的病因还有很长的路要走[2]。因此,有必要继续广泛的探索,以发现新的癌症危险因素。
众所周知,癌症是一种受遗传和环境因素综合影响的多因子疾病[3]。许多环境因素,如吸烟、饮酒和不健康的饮食习惯已被证实与患癌症的风险有关[4]。遗传风险因素也已成为导致癌症的重要常见因素[5]。虽然已经被发现了许多遗传标记[6],但仍迫切需要识别各种类型癌症的新型分子标记,这将有助于解释癌发生的潜在机制。
DNA连接酶(DNAligase, LIG)基因包括LIG1、LIG3和LIG4,属于Base-cut Repair genes (BER),在复制和重组过程中,在保持基因组完整性方面发挥着重要作用[7-10]。在癌症中已经观察到每个DNA LIG基因的过表达,这被认为在肿瘤的发生、进展、侵袭和转移中起作用[7,11,12]。与LIG1和LIG4基因不同,LIG3可以编码多种DNA连接酶多肽[7]。这些多肽可能参与了细胞核和线粒体DNA的代谢。除了在BER过程中出现的封闭缺口外[13,14],LIG3也可以在线粒体基因组的维护中发挥重要作用[15,16]。
2. 研究内容和问题
癌症已经成为威胁全球公共卫生的重大问题。近年来,癌症治疗方法和技术有了显著的改进,然而,要完全揭示癌症的病因还有很长的路要走。因此,本研究旨在探索新的癌症危险因素。
DNA连接酶(LIG)基因,包括LIG1、LIG3和LIG4,属于碱基切除修复基因(BER),在复制和重组过程中对维持基因组完整性起着重要作用。已在癌症中观察到每个DNA LIG基因的过度表达,这被认为在肿瘤的发生、进展、侵袭和转移中起作用。其中,LIG3可以编码多种类型的DNA连接酶多肽,这些多肽可能参与细胞核和线粒体DNA代谢。LIG3中的单核苷酸多态性(SNPs)可能影响LIG3的表达水平和功能,改变DNA修复能力和基因组完整性,并进一步影响癌症易感性。许多研究已经讨论了LIG3中的SNPs与癌症易感性之间的关系。目前,LIG3已报告的SNP包括rs3136025、rs3744356、rs4796030、rs1052536、rs2074522、rs3135967、rs3135983、rs4986974和rs3744358。然而,我们发现来自不同研究者的上述关联研究不能得出相同的结论,并且LIG3及其单核苷酸多态性在癌症风险中的作用还不太清楚。因此,本研究中,我们将利用多种方法和途径来确定LIG3和相关SNPs对癌症风险的影响,并探索其潜力机制。
3. 设计方案和技术路线
(1)初步功能注释
我们利用几个重要的注释网站初步探索候选SNPs在LIG3中的潜在功能。这些网站包括:RegulomeDB,HaploReg,snpinfo,和UCSC。
(2)Meta分析
4. 研究的条件和基础
(1)课题由经验丰富、具备扎实的实验理论和实践能力的老师负责指导;
(2)南通大学图书馆拥有文献查询系统,可通过网上图书管查阅文献,为撰写论文提供了帮助;
(3)熟悉流行病学基本原理,并具备一定的英文文献阅读能力。此外,熟悉Stata,可利用该软件进行数据分析。以上是毕业论文开题报告,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。