1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
我国山羊存栏数、羊肉产量、山羊绒产量均排在世界第一位,其中存栏数约占世界山羊存栏总数的 22.6%。
但目前国内羊肉产量仍无法满足消费者日益增长的需求,2016 年羊肉进口量达22.01万吨。
与此同时,消费者对羊肉的品质要求也越来越高。
2. 研究的基本内容和问题
研究RNA-Seq对发情山羊卵泡基因表达水平的影响。
确定了几种可能的基因和途径参与了肥胖山羊的卵泡发育。
比较肥胖组和对照组的雌二醇(E2)、孕酮(P4)、瘦素和脂联素在滤泡液中的浓度,以发现卵泡发育的潜在生物标志物。
3. 研究的方法与方案
(1)取样将同一年龄(9个月大)的72只母山羊在全营养条件下被混合定量(TMRs, 60:40粗粮和精料)饲养。
由公山羊诊断出自然发情,24只发情山羊分为两组:BCS > 3.5(肥胖组,n=10)和BCS =3.0(正常组,对照组,n=14)。
将24只发情7- 8h的山羊在当地屠宰场宰杀,摘取124只卵巢。
4. 研究创新点
(1)以不同直径的卵泡为转录组测序对象,差异基因表达研究的对象更精准,克服了以往的研究大多以整个卵巢为转录组测序对象,造成不同大小卵泡转录本混合,导致筛选有价值差异表达基因受限的问题。
(2)利用卵泡液代谢组学筛选分析与该卵泡中卵母细胞发育潜能相关的标记代谢物,验证卵泡液中激素水平作为卵母细胞发育能力预测指标的可行性或筛选出其他标记物。
(3)研究不同体况评分山羊卵泡中基因表达的差异性以此可验证不同基因山羊卵巢中的细胞特异性。
5. 研究计划与进展
(1)2017.07卵巢采样,进行处理(2)2017.07-2018.01进行卵泡RNA的提取,转录组测序分析,DEGs的功能分类和聚类分析,GO和KEGG分析确定其生物途径和功能,进行定量实时PCR验证。
(3)2018.3-2018.4利用SPSS对所获得的实验数据进行统计学分析。
(4)2018.4-2018.5论文撰写和结题。
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