13号染色体上SNP位点rs332069453、 rs81447100、g.80866840多态性对梅山猪产仔性状的影响开题报告

 2023-02-16 09:06:59

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1. 课题意义产仔数的高低直接影响养猪生产经济效益,解析产仔数变异的遗传机理具有重要理论和应用价值。

产仔数是一个复杂的性状,受到排卵率、胚胎/胎儿存活率、子宫容积等诸多因素的影响。

梅山猪是我国产仔性能最优秀的国家级畜禽遗传资源保护品种,因其高产性能作为国礼赠送给法国,并且极大提升了西方猪的产仔性能,有之前的窝产8-9头提升到12-13头,国内外大量研究发现梅山猪产仔数性状存在主效基因遗传[1,2],因此以梅山猪为研究素材鉴别影响猪产仔数的关键基因位点,将为猪产仔数遗传改良提供重要分子标记。

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2. 研究的基本内容和问题

1. 研究目标a) 检测rs332069453位点在约300头来自苏太、昆山、太仓保种场的梅山母猪内的基因型;b) 分析这些SNP位点不同基因型与窝产仔数的关联性。

2. 研究内容a) 试验动物来源采集具有准确窝产总仔数记录的约300头梅山母猪的耳组织样品,放置于装有70%酒精的离心管内,-20℃冰箱保存备用。

利用传统酚/氯仿法提取耳组织基因组DNA,经过质量、浓度检测后将浓度稀释到30ng/μL于-20℃下保存备用。

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3. 研究的方法与方案

1. 研究方法采用实验室检测与动物试验相结合的方法开展相关试验研究。

2. 技术路线见附件3. 实验方案a) 试验动物来源采集具有准确窝产总仔数记录的320头自苏太、昆山、太仓保种场的梅山母猪的耳组织样品,放置于装有70%酒精的离心管内,-20℃冰箱保存备用。

利用传统酚/氯仿法提取耳组织基因组DNA,经过质量、浓度检测后将浓度稀释到30ng/μL于-20℃下保存备用。

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4. 研究创新点

梅山猪是我省特色地方猪种资源,以梅山猪为研究对象,鉴别并验证rs332069453多态性对梅山猪产仔性状的影响,进行基因型与产仔数的关联分析,试验结果将为解析产仔数变异分子机理提供部分理论依据,为选育梅山猪地方品种稳定高产群体提供关键分子标记。

5. 研究计划与进展

2017年8月--10月:采集具有准确窝产总仔数记录的约300头梅山母猪的耳组织样品;2017年11月--12月:利用传统酚/氯仿法提取耳组织基因组DNA,经过质量、浓度检测后将浓度稀释到30ng/μL于-20℃下保存备用;2018年1月:用已提取的DNA为模板,根据所设计的引物,进行PCR扩增;2018年3月: PCR产物在1.2%琼脂糖凝胶中电泳检测,将剩余的扩增产物进行测序,比对、分析测序结果,判读突变的基因型,然后进行基因型对表型的影响效应分析;2018年4月: 整理数据,差缺补漏。

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