1. 研究目的与意义
内容：β-内酰胺类抗生素是应用最广泛的三大类抗生素之一，但是由于耐药问题的逐渐增加，使得这类抗生素的使用受到一定程度的限制。
PBP耐药机制；1.产生钝化酶或者水解酶.尚有机制还不完全清楚；例如，1.有些细菌还可以形成生物被膜来抵抗抗菌药物与逃避免疫系统的吞噬作用。
2例如M（methicillin resistant Staphylococcus aureus）具有多重耐药性，其产生机制是PBPs改变的结果，高度耐药性系由于原有的PBP2与PBP3之间产生一种新的PBP2（即PBP2a）本研究拟通过分子对接，分子动力学模拟技术研究PBP2a耐β-内酰胺类抗生素的作用机制，理解PBP2a耐药的机理，为设计新的β-内酰胺类抗生素以及PBP抑制剂提供指导。
2. 文献综述
头孢菌素类抗菌药的开发历程与研究近况摘要 头孢菌素类抗菌药物因具有抗菌作用强、临床疗效高、耐青霉素酶、毒性低、过敏反应较青霉素少等优点，经过半个多世纪的发展，已有近 70 个品种广泛应用于临床。
目前通常将头孢菌素类药物分为五代，每代药物都有其各自特点和不同的临床适应证。
不过，随着头孢菌素类药物的广泛应用，细菌耐药问题也如影随形。
3. 设计方案和技术路线
研究方案：（1） 从蛋白质数据库得到PBP2a以及PBP2a与β-内酰胺类抗生 素复合物的三维结构（2） 利用AmberTool16，选取合适的蛋白质β-内酰胺类力场参数，进行结构优化（3） 对PBP2a以及PBP2a与β-内酰胺类抗生素复合物进行水溶液中动力学模拟（4） 从动力学轨迹分析PBP2a活性位点的构象变化，从可能的构象变化分析其耐药机制技术路线PBP2a蛋白质结构 分配力参数分子动力学模拟动力学轨迹动力学构象变化分析及机理解释PBP2a-β-内酰胺复合物分配力参数分子动力学模拟动力学轨迹动力学构象变化分析及机理解释
4. 工作计划
1.15-2.23查阅整理文献2.24-3.17完成开题报告3.18-5.31进行课题实验6.1-6.9完成毕业论文设计
5. 难点与创新点
本课题基于实验基础，用分子动力学模拟方法研究β-内酰胺类抗生素的耐药机制。
有利于提高效率，降低不必要的浪费。
通过对耐药机制的研究能够提高药物的药效，使得病人能够得到更好的治疗。
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