1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）
水稻作为亚洲尤其是东南亚人口的主要粮食作物，其重要性是不言而喻的，如何实现水稻高产、优质、高效、规模化生产是广大农业科研人员的奋斗目标，由于基因决定结构，结构决定性质，为了定性分析这二者之间的差异，对它们进行多态性分析是有必要的。本研究基于这样一个大的时代背景下，从水稻基因的角度，运用SSR技术，试图探索出实现上述目标的方法。因此，本研究拟运用SSR技术，对生产中两种优良品种武育粳三号和扬稻六号的DNA，通过用特定引物扩增，找出二者差异，从而为进一步研究提供更好的基础和经验。
要精确研究二者的基因差异，需要一种数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高具有多等位基因的特性，提供的信息量高,并且以孟德尔方式遗传，呈共显性,每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互交流合作开发引物,那么应用SSR标记技术成为一种必要方法。
洪德林等采用68对SSR标记对江苏省生产上应用的5个粳稻杂交组合的杂种F1及其亲本进行扩增，发现在68对引物中有15对在亲本中表现出稳定的多态性且在杂种F1表现为父母本互补带型引物，每一个组合获得了6-9对多态性引物，不同组合间多态性频率在8.8%-13.2%，引物RM5629和RM259可以区分5个组合内的亲本和杂交种，引物RM224不仅可以区分除86优8号以外的4个组合内F1及亲本种子，可以同时区分3个不同的组合。
2. 研究的基本内容和问题
基于SSR分子标记技术对不同性状的水稻品种进行分子水平的分析，具体实验步骤是先找出两株性状差异显著的植株进行DNA提取，接着用特定64种引物扩增12条染色体特定引物，最后在凝胶电泳技术下分离出不同大小DNA，找出特定的差异片段，从而可以定位出该片段DNA是否在性状表达中起作用，并且为下一步更深层的研究提供的基础。
3. 研究的方法与方案
目前该技术已广泛用于遗传图谱的构建、目标基因的标定、指纹图的绘制等研究中。但应看到，SSR标记的建立首先要对微卫星侧翼序列进行克隆、测序、人工设计合成引物以及标记的定位、作图等基础性研究，因而其开发费用相当高，各个实验室必须进行合作才能开发更多的标记。由于SSR标记具有较大的应用价值，且种属特异性较强，目前在一些主要的农作物中SSR标记研究都进行了合作。
因此本实验运用SSR分子标记技术定位武育粳3号和扬稻6号以及日本晴、矮脚南特等品种特殊对的DNA片段，通过特定引物而使目标片段进行PCR扩增，凝胶电泳法使目标片段迁移，最后在紫外光灯下找出二者在在相同引物下DNA序列差异。
4. 研究创新点
与其它分子标记相比，SSR标记具有以下优点：(1)数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高；(2)具有多等位基因的特性，提供的信息量高；(3)以孟德尔方式遗传，呈共显性；(4)每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互交流合作开发引物。SSR分子标记是目前植物品种鉴定中最具有应用潜力的标记，已应用于很多作物的品种鉴定，本实验就是在前人基础上采用巧妙运用SSR技术，结合PCR扩增指定片段来进行不同品种水稻差异性分析的。
5. 研究计划与进展
先期筛选出性状差异比较显著的武育粳3号和扬稻6号的植株用DNA提取盒进行DNA提取，然后在相同引物下扩增出来特定的DNA片段，进行凝胶电泳后在紫外光灯下显示并进行拍照，最后从照片中找出差异，并记录分析。目前已完成大部分引物扩增，剩余部分目前也在进一步准备中。
2016.1-2016.3利用剩余引物进行DNA片段扩增，做出初步分析
2016.3-2016.5综合数据分析，撰写论文
以上是毕业论文开题报告，课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。
